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【關(guān)鍵詞】高專(zhuān)院校醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教學(xué)方法
在醫(yī)學(xué)類(lèi)高專(zhuān)院校中,醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)是一門(mén)和臨床醫(yī)學(xué)有著密切關(guān)系的過(guò)渡性的學(xué)科。與之相關(guān)的教學(xué)內(nèi)容范圍很廣,除了基本的理論知識(shí)講述外,還包括對(duì)學(xué)生臨床分析能力的培養(yǎng),是一門(mén)重要課程。但是由于高專(zhuān)院校課程本身任務(wù)重、課時(shí)少,這就給教學(xué)工作帶來(lái)一些困難。當(dāng)前形勢(shì)下,工作的重點(diǎn)應(yīng)該放到怎樣盡快制定一套合理的教學(xué)方法上。
一、合理選材
在高專(zhuān)院校中,該項(xiàng)課程主要是通過(guò)合理的教學(xué)以及學(xué)習(xí),確保學(xué)生掌握基礎(chǔ)知識(shí)以及技能,并能有效利用。具體講有如下幾點(diǎn):認(rèn)識(shí)遺傳的規(guī)律以及基礎(chǔ),突變的原因;了解具體的分類(lèi)以及特點(diǎn);掌握分析、治療的基本方法;熟悉分子遺傳知識(shí)。綜合來(lái)看,主要的課程內(nèi)容有如下幾點(diǎn):①基礎(chǔ)知識(shí),具體指遺傳的基礎(chǔ)、單基因以及多基因的遺傳病、疾病的咨詢(xún)及防治等。②最新的學(xué)科進(jìn)展。③分子遺傳以及分子生物相關(guān)學(xué)科的知識(shí)。
二、進(jìn)行教學(xué)改革
首先,優(yōu)化授課方法及內(nèi)容。
高專(zhuān)院校的學(xué)生本身在高中時(shí)期就學(xué)過(guò)生物課,對(duì)遺傳學(xué)知識(shí)有一定的掌握。這些知識(shí)為我們掌握醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)的相關(guān)理論打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),但醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和普通的遺傳學(xué)有很大的不同。選擇合理的教學(xué)內(nèi)容以及方法有助于學(xué)生更好地掌握課程。一般,高專(zhuān)院校都為三年制,真正地理論學(xué)習(xí)期只有兩年,同時(shí)知識(shí)內(nèi)容又比較復(fù)雜,這些特點(diǎn)決定了教師必須合理地選擇授課內(nèi)容以及方法。具體有以下內(nèi)容,①優(yōu)化教學(xué)內(nèi)容:醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)可分為群體遺傳等六大板塊,應(yīng)依次講解。②精心選取授課方法:按照課程的重點(diǎn)來(lái)合理地選取方法。選擇授課方式時(shí),老師應(yīng)改變傳統(tǒng)思想,認(rèn)識(shí)到自身的主導(dǎo)地位,開(kāi)展課堂講述的目的是為了引導(dǎo)學(xué)生更好地學(xué)習(xí)課堂知識(shí)。
其次,重視實(shí)驗(yàn)課的效果。
開(kāi)設(shè)實(shí)驗(yàn)課是為了培養(yǎng)學(xué)生的試驗(yàn)?zāi)芰?,同時(shí)有助于學(xué)生鞏固知識(shí),從實(shí)驗(yàn)中體會(huì)到濃厚地學(xué)習(xí)樂(lè)趣,激勵(lì)學(xué)生更加努力學(xué)習(xí)。針對(duì)個(gè)別學(xué)校不重視實(shí)驗(yàn)課開(kāi)展的情況,應(yīng)具體的根據(jù)學(xué)校的情況,合理選擇內(nèi)容開(kāi)展實(shí)驗(yàn)活動(dòng)。這有這樣才能培養(yǎng)出適合新時(shí)展的新型人才。
第三,加強(qiáng)臨床實(shí)習(xí)。
隨著工業(yè)化進(jìn)程的加快,環(huán)境污染越來(lái)越嚴(yán)重,遺傳病的發(fā)病幾率也越來(lái)越高。統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,近年來(lái)遺傳病的增長(zhǎng)率相當(dāng)驚人。這些疾病表現(xiàn)在臨床的不同專(zhuān)業(yè),所以醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)更確切地說(shuō)是一門(mén)臨床學(xué)科。大多數(shù)的學(xué)生畢業(yè)后多從事臨床或相關(guān)的工作,因此我們的教學(xué)就應(yīng)該著重注意培養(yǎng)臨床能力,而這種能力的獲得需要通過(guò)不斷地臨床實(shí)習(xí)。教師應(yīng)盡最大努力地創(chuàng)造條件鍛煉學(xué)生地臨床能力,比如使用多媒體輔助教學(xué)等方式。通過(guò)不同的方式提高學(xué)生的診斷、分析、解決疾病等相關(guān)的臨床能力,比如可以根據(jù)患者在臨床上的表現(xiàn)來(lái)斷定遺傳病的種類(lèi)等。通過(guò)對(duì)學(xué)生的臨床能力技能的培養(yǎng)可以確保學(xué)有所用。通過(guò)不斷的實(shí)踐發(fā)現(xiàn),將臨床和課堂相結(jié)合地方式對(duì)于提高教學(xué)效果有非常大的幫助。
第四,充分利用課外陣地。
分子生物學(xué)的發(fā)展和生命科學(xué)研究的深入不斷的補(bǔ)充和完善著醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)基礎(chǔ)理論和臨床實(shí)踐,這點(diǎn)對(duì)于那些畢業(yè)后就走上臨床崗位的學(xué)生來(lái)講是非常重要的。但是目前,由于高專(zhuān)院校開(kāi)展的醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)課時(shí)比較少、內(nèi)容比較多,這些特點(diǎn)就使得老師不應(yīng)過(guò)分地傳授研究進(jìn)展情況,主要是因?yàn)檫@會(huì)使得理論知識(shí)和臨床實(shí)踐脫節(jié)。當(dāng)前形勢(shì)下,教師的工作重點(diǎn)應(yīng)放到如何最大程度地幫學(xué)生補(bǔ)充研究進(jìn)展情況。由于大學(xué)生的課余時(shí)間比較多,可以采用很多方法開(kāi)展課外學(xué)習(xí),比如學(xué)術(shù)講座、興趣小組等形式。這些活動(dòng)的開(kāi)展不僅幫助學(xué)生了解最新情況,同時(shí)還有助于他們鞏固基礎(chǔ)知識(shí),鍛煉分析以及處理疾病的能力。
第五,不斷完善測(cè)評(píng)制度。
應(yīng)該打破傳統(tǒng)的那種通過(guò)考卷來(lái)評(píng)定學(xué)生學(xué)習(xí)效果的制度。傳統(tǒng)制度帶來(lái)的負(fù)面影響是出現(xiàn)了大批高分低能學(xué)生。高專(zhuān)院校學(xué)生今后的職業(yè)方向決定了學(xué)生不僅要有堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ),還要有很強(qiáng)的實(shí)踐能力以及心理素養(yǎng)。所以教師對(duì)學(xué)生學(xué)習(xí)的考核應(yīng)該是對(duì)綜合能力的考核,真正使考核成績(jī)能合理地反映出學(xué)生的綜合素質(zhì)。當(dāng)前,我們必須要不斷地完善現(xiàn)存的考核標(biāo)準(zhǔn),要將各類(lèi)因素綜合起來(lái),比如學(xué)生課堂上的表現(xiàn)、回答問(wèn)題的情況以及完成作業(yè)的情況等,把各項(xiàng)成績(jī)采取加權(quán)法有效計(jì)入總成績(jī)中,這樣可以合理地反映出他們的綜合素養(yǎng)。
三、結(jié)論
醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)是一門(mén)和臨床醫(yī)學(xué)有著密切關(guān)系的過(guò)渡性的學(xué)科,更確切地說(shuō)是一種偏向臨床的學(xué)科。高專(zhuān)院校肩負(fù)培養(yǎng)新時(shí)代人才的重要任務(wù),因此如何有效地開(kāi)展醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)課程就成為了當(dāng)前工作的重點(diǎn)。教師的所有教學(xué)活動(dòng)要確保和此重點(diǎn)相關(guān),不論是優(yōu)化知識(shí)內(nèi)容還是精選講課方法,亦或是從開(kāi)設(shè)實(shí)驗(yàn)課到開(kāi)展臨床見(jiàn)習(xí)活動(dòng)都要認(rèn)真地圍繞這個(gè)重點(diǎn)進(jìn)行。除此之外,講課過(guò)程中要密切關(guān)注研究的最新情況,通過(guò)合理的課外活動(dòng)傳遞相關(guān)信息。只有綜合做到以上幾點(diǎn)才能培養(yǎng)出適合時(shí)展的新型人才。
參考文獻(xiàn)
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關(guān)鍵詞 表觀遺傳學(xué);獲得性遺傳;靈活性;可逆性
中圖分類(lèi)號(hào) Q3 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 1007-5739(2013)08-0248-02
表觀遺傳是指生物不改變基因序列而只通過(guò)化學(xué)修飾來(lái)調(diào)控基因表達(dá)所導(dǎo)致的可遺傳的改變,與之對(duì)應(yīng)的學(xué)科就是表觀遺傳學(xué)(epigenetics),它最早于1939 年由英國(guó)學(xué)者Waddington在其著作《現(xiàn)代遺傳學(xué)導(dǎo)論》一書(shū)中提出,當(dāng)時(shí)認(rèn)為表觀遺傳學(xué)是研究基因型產(chǎn)生表型的過(guò)程[1-3]。近年來(lái),表觀遺傳學(xué)已成為生命科學(xué)研究的前沿和熱點(diǎn),其幫助生物適應(yīng)環(huán)境和應(yīng)對(duì)外力脅迫的作用和優(yōu)勢(shì)已逐漸被揭示出來(lái),不僅在改良生物新品種和防治疾病等應(yīng)用方面顯示了巨大的潛力,而且還為人類(lèi)進(jìn)一步認(rèn)識(shí)和理解生物進(jìn)化提供了全新的思維方式。
1 表觀遺傳修飾
表觀遺傳修飾主要包括DNA甲基化和組蛋白修飾[1,4]。DNA甲基化是真核生物基因組中最常見(jiàn)的一種DNA共價(jià)修飾形式。在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化學(xué)性修飾堿基,CG二核苷酸是甲基化的主要位點(diǎn)。DNA甲基化時(shí),胞嘧啶從DNA雙螺旋突出,進(jìn)入能與酶結(jié)合的裂隙中,在胞嘧啶甲基轉(zhuǎn)移酶催化下,有活性的甲基從S-腺苷甲硫氨酸轉(zhuǎn)移至胞嘧啶5′位上,形成5-甲基胞嘧啶(5m C)。真核生物中有2%~7%的胞嘧啶存在甲基化修飾,同時(shí)70%的5-甲基胞嘧啶參與了CpG序列的形成,而非甲基化的CpG序列則與管家基因以及組織特異性表達(dá)基因有關(guān)。DNA甲基化會(huì)導(dǎo)致基因轉(zhuǎn)錄抑制或沉默,與胚胎發(fā)育、組織特異性基因的表達(dá)調(diào)控、X染色體失活和基因組印記等密切相關(guān),不僅可影響細(xì)胞基因的表達(dá),而且這種影響還可隨細(xì)胞分裂而遺傳下去。
組蛋白是染色體基本結(jié)構(gòu)——核小體中的重要組成部分,其氨基端尾巴上的許多殘基可以被共價(jià)修飾,包括甲基化、乙?;?、磷酸化、泛素化、多聚ADP糖基化、羰基化等修飾,其中甲基化和乙?;亲钇毡樽钪匾慕M蛋白修飾。組蛋白修飾可影響組蛋白與DNA雙鏈的親和性,改變?nèi)旧|(zhì)的疏松或凝集狀態(tài),也可影響其他轉(zhuǎn)錄因子與結(jié)構(gòu)基因啟動(dòng)子的親和性,調(diào)控基因表達(dá),進(jìn)而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄激活或基因沉默,參與細(xì)胞分裂、細(xì)胞凋亡和記憶形成等眾多生命過(guò)程。
除了DNA甲基化和組蛋白修飾外,表觀遺傳修飾還有染色質(zhì)重塑、基因組印記、非編碼RNA和副突變等。研究表明,表觀遺傳修飾過(guò)程是相當(dāng)復(fù)雜的,許多修飾存在著依賴(lài)關(guān)系和協(xié)同作用[4]。比如,組蛋白修飾可以指導(dǎo)DNA甲基化[5-7],從而導(dǎo)致基因沉默或激活。同時(shí),DNA甲基化也可引導(dǎo)組蛋白修飾[8-9],進(jìn)而影響基因轉(zhuǎn)錄等。
2 靈活性
由于化學(xué)修飾比改變基因結(jié)構(gòu)更快捷、更容易,所以相對(duì)于穩(wěn)固的基因型遺傳來(lái)說(shuō),表觀遺傳則具有更大的靈活性。這為生物快速適應(yīng)千變?nèi)f化的環(huán)境提供了一種適宜的應(yīng)變機(jī)制。最新的研究發(fā)現(xiàn),古生物能夠適應(yīng)快速變化的環(huán)境所依賴(lài)的正是表觀遺傳修飾。在距今3萬(wàn)年前,全球氣候波動(dòng)頻繁,短時(shí)間內(nèi)便可出現(xiàn)巨大起伏。按照傳統(tǒng)的“基因突變+自然選擇”的進(jìn)化模式,生物肯定難以跟上這么快的節(jié)奏,然而事實(shí)上絕大多數(shù)生物都能夠快速地適應(yīng)這種巨大的氣候變化壓力而不至于滅絕,這其中的秘密就在于表觀遺傳修飾。Llamas et al[10]通過(guò)對(duì)凍土層中發(fā)掘出的3萬(wàn)年前美洲野牛的DNA胞嘧啶甲基化分析,發(fā)現(xiàn)這一時(shí)期野牛的表觀遺傳變化在2代內(nèi)即可產(chǎn)生,也就是說(shuō),產(chǎn)生可遺傳變異所需的時(shí)間遠(yuǎn)低于傳統(tǒng)進(jìn)化模式所需要的時(shí)間。這一結(jié)果表明,是表觀遺傳修飾幫助古代的動(dòng)物度過(guò)了環(huán)境巨變的難關(guān)。具有土生習(xí)性的植物,由于難于移動(dòng),其生長(zhǎng)、發(fā)育和繁殖更容易遭受逆境(如干旱、病蟲(chóng)侵襲和輻射等)脅迫影響。面對(duì)各種逆境壓力,植物應(yīng)變的對(duì)策也是表觀遺傳修飾。美國(guó)學(xué)者Dowen et al[11]研究發(fā)現(xiàn),植物在受到病菌侵襲時(shí),其全基因組會(huì)出現(xiàn)大量DNA甲基化修飾的改變,并且這種甲基化修飾會(huì)因環(huán)境刺激的變化而變化,以動(dòng)態(tài)的方式調(diào)控基因表達(dá),限制感染病菌的生長(zhǎng),幫助植物抵御病菌的入侵。表觀遺傳與環(huán)境密切相關(guān),所以植物表觀基因組存在明顯的地域差異[12],這種表觀遺傳差異在幫助生物適應(yīng)不同的環(huán)境和向多樣性發(fā)展方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。
3 習(xí)得性
表觀遺傳修飾有2個(gè)明顯特征:一是受環(huán)境影響,生物可以通過(guò)表觀遺傳修飾來(lái)改變性狀;二是這些與環(huán)境相適應(yīng)的表型(性狀)可以遺傳下去。這2個(gè)特征所表現(xiàn)出的獲得性遺傳,為生物的多樣性和種群的適應(yīng)性演化提供了一種習(xí)得性進(jìn)化機(jī)制。最早關(guān)于DNA甲基化的可遺傳特性是通過(guò)agouti viable yellow(Avy)小鼠模型研究發(fā)現(xiàn)的。該研究確定了一個(gè)啟動(dòng)子被甲基化的程度與小鼠的毛色(即棕色小鼠)的關(guān)聯(lián)性[13-14]。英國(guó)學(xué)者Enrico Coen及其同事[15]發(fā)現(xiàn),在野生植物群體中存在可遺傳的具甲基化修飾的突變株。一種名為柳穿魚(yú)的野生植物的正常植株的花呈兩側(cè)對(duì)稱(chēng)狀。Enrico Coen et al在研究中發(fā)現(xiàn)了一種突變體,該突變體的花呈輻射對(duì)稱(chēng)狀,而這一表型突變是由一個(gè)叫Lcyc的基因被甲基化修飾導(dǎo)致的,該基因與控制金魚(yú)草(Antirrhinum)的背腹不對(duì)稱(chēng)的cycloidea基因同源。Lcyc的基因高度甲基化導(dǎo)致基因沉默,無(wú)法正常轉(zhuǎn)錄,這一基因在向后代傳遞時(shí)保持了甲基化狀態(tài),后代植株的花也呈輻射對(duì)稱(chēng)狀。Rechavi et al[16]在一項(xiàng)研究中發(fā)現(xiàn),表觀遺傳能夠幫助線蟲(chóng)獲得可遺傳的免疫力。他們利用一種昆蟲(chóng)病毒Flock house virus(FHV)感染線蟲(chóng),發(fā)現(xiàn)線蟲(chóng)通過(guò)RNA干擾的方式沉默病毒基因從而獲得了針對(duì)這一病毒的免疫力。當(dāng)這些線蟲(chóng)的后代再暴露在這類(lèi)病毒中時(shí),它們?nèi)匀痪哂袑?duì)病毒的免疫力。
由表觀遺傳所致的獲得性遺傳現(xiàn)象不僅發(fā)生在線蟲(chóng)、植物中,而且在小鼠、豬和人類(lèi)的研究中均被發(fā)現(xiàn)[16-19]。這種獲得性遺傳對(duì)于生物積累應(yīng)對(duì)外力脅迫的經(jīng)驗(yàn)和向多樣性發(fā)展是極其重要的。一些生物之所以能夠在十分惡劣的環(huán)境和強(qiáng)大的天敵脅迫下長(zhǎng)久生存下來(lái)并不斷進(jìn)化,一個(gè)重要的原因就是生物能夠遺傳和繼承抗脅迫的能力。雖然目前還不能證明表觀遺傳會(huì)轉(zhuǎn)化為基因型遺傳,但是從表觀遺傳的機(jī)制來(lái)看,這種轉(zhuǎn)化是完全可能的。因?yàn)橛醒芯堪l(fā)現(xiàn),DNA甲基化修飾可以永久改變遺傳密碼。例如,胞嘧啶C的甲基化會(huì)使核酸經(jīng)脫氨基作用轉(zhuǎn)變?yōu)樾叵汆奏[20]。按照遺傳漂變中性理論[21],C轉(zhuǎn)變?yōu)門(mén)的過(guò)程應(yīng)該是隨機(jī)的,但是人們發(fā)現(xiàn)甲基化CpG島中的自發(fā)性脫氨基比非甲基化CpG序列中的將近快2倍,而人類(lèi)基因組中近80%的甲基化位點(diǎn)發(fā)生在CpG序列中的C上(后跟有鳥(niǎo)嘌呤G)。這些現(xiàn)象用“隨機(jī)”無(wú)法解釋?zhuān)祟?lèi)更相信是生物機(jī)體有目的的為之。或許表觀遺傳是基因型遺傳的前奏和準(zhǔn)備,而基因型遺傳則是表觀遺傳的積累和沉淀。所以,表觀遺傳很可能是基因型遺傳的一個(gè)中間過(guò)渡階段,通過(guò)這個(gè)中間過(guò)程的篩選,可以把更適應(yīng)的性狀選擇和保留下來(lái),以有利于生物的生存和進(jìn)化。
4 可逆性
表觀遺傳的可逆性主要是指表觀修飾的可逆性。這種可逆性既可使基因沉默[22-23],又能夠激活基因[24-25]。反映到表型上就是一種性狀既可后天獲得并能夠遺傳下去,也可在獲得后又很快消失。這種可逆性也是一種靈活性,它在生物某些機(jī)能和組織的自我矯正、修復(fù)中發(fā)揮了重要作用。表觀遺傳修飾其實(shí)也是一把雙刃劍,它雖然在幫助生物快速適應(yīng)環(huán)境和應(yīng)對(duì)外力脅迫方面起著至關(guān)重要的作用,但是不當(dāng)?shù)谋碛^遺傳修飾也會(huì)對(duì)生物產(chǎn)生負(fù)面作用,如導(dǎo)致細(xì)胞癌變等[26-27]。基因突變引發(fā)的癌變是無(wú)法逆轉(zhuǎn)的,但是表觀遺傳修飾(表型突變)導(dǎo)致的癌變則可以通過(guò)表觀遺傳修飾來(lái)治愈。例如,Okada et al[28]發(fā)現(xiàn)了一種蛋白質(zhì)復(fù)合體——延伸體(elongator),能夠清除DNA上的表觀遺傳標(biāo)記物,對(duì)胚胎發(fā)育過(guò)程形成不同類(lèi)型的細(xì)胞有重要作用。這種延伸體就可能通過(guò)清除表觀遺傳標(biāo)記的方式再次激活腫瘤抑制基因,從而使腫瘤細(xì)胞逆轉(zhuǎn)化為正常細(xì)胞。趙雅瑞等[29]發(fā)現(xiàn),siRNA誘導(dǎo)EZH2基因增強(qiáng)子的表觀沉默能夠抑制前列腺癌細(xì)胞的增殖和生長(zhǎng)。近年來(lái),類(lèi)似的表觀遺傳抑制癌細(xì)胞生長(zhǎng)的研究層出不窮[26-27,30]。另外,在細(xì)胞分裂和DNA復(fù)制中經(jīng)常會(huì)發(fā)生DNA雙鏈斷裂,需要及時(shí)修復(fù),否則就會(huì)影響基因組的穩(wěn)定,引發(fā)癌變。研究表明,組蛋白的共價(jià)修飾,包括甲基化、乙?;⒘姿峄?、泛素化等修飾,對(duì)DNA修復(fù)進(jìn)程起著關(guān)鍵的調(diào)控作用[31]。
5 結(jié)語(yǔ)
表觀遺傳修飾具有不改變DNA序列而能夠?qū)е逻z傳變化的特點(diǎn),為生物快速適應(yīng)瞬息萬(wàn)變的環(huán)境和應(yīng)對(duì)外力脅迫提供了一種應(yīng)變機(jī)制。但是,這種機(jī)制對(duì)生物適應(yīng)環(huán)境、多樣性發(fā)展和生物進(jìn)化的作用目前還無(wú)法評(píng)估。隨著研究的深入,表觀遺傳修飾的分子機(jī)制和若干修飾細(xì)節(jié)將逐步被揭示,表觀遺傳的優(yōu)勢(shì)和作用必將進(jìn)一步地凸顯在人類(lèi)面前。
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均有著很重要的作用[1]。教育部于上個(gè)世紀(jì)90年代提出"高等教育面向21世紀(jì)教學(xué)內(nèi)容和課程體系改革計(jì)劃"以及《關(guān)于進(jìn)_步加強(qiáng)高等學(xué)校本科教學(xué)工作的若干意見(jiàn)》,各高校都開(kāi)展了_系列卓有成效的探索,對(duì)提高《遺傳學(xué)》乃至整個(gè)生命科學(xué)的教學(xué)質(zhì)量起到了巨大的推動(dòng)作用,很多工作已在相關(guān)全國(guó)教學(xué)會(huì)議上交流,或在有關(guān)期刊/論文集中正式發(fā)表。由于遺傳學(xué)是生物科學(xué)領(lǐng)域中發(fā)展最快的學(xué)科之一,新技術(shù)、新方法不斷涌現(xiàn),研究范疇不斷拓寬,研究?jī)?nèi)容不斷深化,遺傳學(xué)知識(shí)的積累量越來(lái)越大,迫切需要有一個(gè)好的教學(xué)體系對(duì)《遺傳學(xué)》教學(xué)過(guò)程加以規(guī)范和提高。我們把優(yōu)質(zhì)教學(xué)體系的改革思路貫穿在整個(gè)《遺傳學(xué)》教學(xué)過(guò)程之中,堅(jiān)持"以學(xué)生為主體、以教師為主導(dǎo)"的方針,以培養(yǎng)"寬基礎(chǔ)、厚知識(shí)、強(qiáng)能力、高素質(zhì)"的優(yōu)秀人才為目標(biāo),改進(jìn)學(xué)生學(xué)習(xí)方式,培養(yǎng)學(xué)生分析問(wèn)題、解決問(wèn)題的能力及綜合素質(zhì)。因此,構(gòu)建優(yōu)質(zhì)教學(xué)體系,在整體上提高了國(guó)家精品課《遺傳學(xué)》的授課質(zhì)量和教學(xué)效果,促進(jìn)精品教育的發(fā)展,同時(shí)也提高了《遺傳學(xué)》教學(xué)平臺(tái)的質(zhì)量和教學(xué)資源的校內(nèi)外無(wú)障礙共享,取得了明顯的課程教學(xué)改革效果。
1優(yōu)質(zhì)教學(xué)體系的建設(shè)
1.1教學(xué)內(nèi)容的優(yōu)化
《遺傳學(xué)》課程建設(shè)和教學(xué)內(nèi)容設(shè)置要遵循現(xiàn)代教育理念,以培養(yǎng)高素質(zhì)、復(fù)合型、富有創(chuàng)新精神和實(shí)踐能力的專(zhuān)門(mén)人才為宗旨,從應(yīng)試教育向開(kāi)放教育發(fā)展。在保持學(xué)科自身完整性與系統(tǒng)性的基礎(chǔ)上,始終把培養(yǎng)學(xué)生的遺傳分析能力放在首位,使學(xué)生更好地掌握遺傳學(xué)的基本規(guī)律、基本理論、基本概念和基本研究方法;在細(xì)胞、個(gè)體、群體和分子等不同層面上對(duì)遺傳學(xué)有較為完整和深入的認(rèn)識(shí),更深、更廣、更準(zhǔn)確地掌握遺傳學(xué)知識(shí),為遺傳學(xué)與人類(lèi)健康、遺傳學(xué)在動(dòng)、植物育種等領(lǐng)域中的應(yīng)用打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),同時(shí)為后續(xù)課程的學(xué)習(xí)和從事相關(guān)工作奠定基礎(chǔ)。為此,要高質(zhì)量地修訂《遺傳學(xué)》課程的教學(xué)大綱,使之能充分反映和體現(xiàn)出本學(xué)科最新發(fā)展趨勢(shì)。在內(nèi)容安排上,以遺傳物質(zhì)的本質(zhì)、傳遞、變異以及遺傳信息的表達(dá)與調(diào)控為主線,從遺傳物質(zhì)的細(xì)胞學(xué)基礎(chǔ)到分子基礎(chǔ)、從遺傳信息的載體到傳遞、從質(zhì)量性狀到數(shù)量性狀、從基因突變到染色體結(jié)構(gòu)變異、從性狀表現(xiàn)到基因的表達(dá)和調(diào)控、從細(xì)胞核遺傳到細(xì)胞質(zhì)遺傳、從個(gè)體遺傳到群體遺傳,知識(shí)傳授由淺入深、由表及里、以簡(jiǎn)帶繁、以點(diǎn)帶面,這樣能在有限的教學(xué)時(shí)間內(nèi)讓學(xué)生系統(tǒng)性地領(lǐng)略遺傳學(xué)的全貌并融會(huì)貫通,用學(xué)到的知識(shí)靈活地解釋_些與遺傳學(xué)有關(guān)的生物學(xué)現(xiàn)象。教師在備課時(shí)將遺傳學(xué)學(xué)科發(fā)展過(guò)程中形成的新知識(shí)、新案例及時(shí)補(bǔ)充到課堂和實(shí)驗(yàn)內(nèi)容之中,結(jié)合實(shí)物、圖片、錄像等進(jìn)行多媒體教學(xué),使《遺傳學(xué)》課堂教學(xué)保持_種新鮮的活力,充滿(mǎn)知識(shí)性、趣味性和吸引力。每章布置一些精選的習(xí)題,有助于提高學(xué)生分析問(wèn)題和解決問(wèn)題的能力。
1.2教學(xué)方法與教學(xué)手段的改革
有效的教學(xué)手段和合理的教學(xué)方法,可以明顯提高《遺傳學(xué)》課程的教學(xué)效果。授課時(shí)采用啟發(fā)式、探究式、開(kāi)放式、討論式、案例式等多種交互式對(duì)話的教學(xué)方法與多媒體教學(xué)手段結(jié)合,把上課、實(shí)驗(yàn)、討論、考核等不同方面有機(jī)地結(jié)合起來(lái),能最大程度地啟發(fā)學(xué)生的主觀能動(dòng)性,在掌握基本理論知識(shí)的同時(shí),全面提高學(xué)生分析和解決遺傳學(xué)問(wèn)題的能力及綜合素質(zhì),培養(yǎng)學(xué)生自主學(xué)習(xí)和創(chuàng)新的能力。如在講述遺傳學(xué)三大定律時(shí),考慮到學(xué)生在高中階段對(duì)這部分內(nèi)容已有所掌握,授課時(shí)不再直述有關(guān)定律的基本內(nèi)容和實(shí)驗(yàn)方法,而是講解孟德?tīng)柡湍柛侨绾尾捎煤线m的研究方法進(jìn)行試驗(yàn),最終獲得正確的結(jié)論;授課過(guò)程中還可隨時(shí)提出一些相關(guān)的問(wèn)題讓學(xué)生思考或回答,提高解決曰常生活中一些具體遺傳學(xué)問(wèn)題的能力。這樣既可以讓學(xué)生聽(tīng)得有趣,還可促使學(xué)生更好地掌握有關(guān)概念、達(dá)到融會(huì)貫通的效果。又如在進(jìn)行遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)時(shí),可以設(shè)計(jì)一些合適的實(shí)驗(yàn)方法,引導(dǎo)學(xué)生通過(guò)一系列的置疑、判斷、比較、選擇,以及相應(yīng)的分析、綜合、概括等多樣化的過(guò)程,由發(fā)散到收斂、求異到求同,通過(guò)實(shí)驗(yàn)最終得到合理的結(jié)果。通過(guò)這一求異和求同的過(guò)程,有利于學(xué)生更深入地理解所獲得的知識(shí)和結(jié)論,而且也可激發(fā)學(xué)生的求知欲、培養(yǎng)他們創(chuàng)新思維的習(xí)慣和能力。在教學(xué)過(guò)程中,逐步加強(qiáng)雙語(yǔ)教學(xué),也能促進(jìn)學(xué)生更好地適應(yīng)遺傳學(xué)學(xué)科的高速發(fā)展,了解和掌握國(guó)內(nèi)外遺傳學(xué)發(fā)展的現(xiàn)狀和趨勢(shì)。學(xué)期結(jié)束時(shí)的"教學(xué)情況反饋問(wèn)卷"和課后征詢(xún)意見(jiàn)制度的實(shí)施,可以多方收集學(xué)生對(duì)課程的教學(xué)意見(jiàn),保持教學(xué)雙向信息反饋通道的暢通。在現(xiàn)代教育技術(shù)應(yīng)用與教學(xué)改革中,CAI教學(xué)課件制作的好壞會(huì)明顯影響《遺傳學(xué)》課程的教學(xué)效果[16,17]。我們?cè)?998年自制《遺傳學(xué)》教學(xué)課件基 礎(chǔ)上,進(jìn)一步編制出以文字、圖片、動(dòng)畫(huà)(視頻)、實(shí)體照片等多種媒體組成的完整教學(xué)課件[18],方便學(xué)生有針對(duì)性地掌握遺傳學(xué)知識(shí)。課件分為課堂版和網(wǎng)絡(luò)版兩種形式,可同時(shí)滿(mǎn)足教師授課和學(xué)生自學(xué)的不同需求,同時(shí)也給教師留下了不斷加工完善和改進(jìn)的空間,能夠適應(yīng)個(gè)性化的教學(xué)。
1.3實(shí)驗(yàn)教學(xué)的創(chuàng)新
遺傳學(xué)是_門(mén)實(shí)驗(yàn)性很強(qiáng)的學(xué)科。隨著遺傳學(xué)的迅速發(fā)展,《遺傳學(xué)》的實(shí)驗(yàn)教學(xué)起著越來(lái)越重要的作用,影響著課程整體水平的提高[19,20]。在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,將啟發(fā)性、探究性的教學(xué)方法貫徹到各個(gè)環(huán)節(jié),使每個(gè)實(shí)驗(yàn)都具有背景知識(shí)的講解和說(shuō)明、過(guò)程的設(shè)計(jì)和實(shí)施、結(jié)果的總結(jié)和提高、理論的考核和評(píng)價(jià)等過(guò)程,將實(shí)驗(yàn)課轉(zhuǎn)變成全方位培養(yǎng)學(xué)生創(chuàng)新意識(shí)和創(chuàng)新能力的小平臺(tái)。在實(shí)驗(yàn)課新體系中有目的地增加國(guó)內(nèi)外遺傳學(xué)科的最新進(jìn)展,增加設(shè)計(jì)性、應(yīng)用性、綜合性實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目,適當(dāng)增加實(shí)驗(yàn)難度,提高學(xué)生操作技能和從事實(shí)驗(yàn)的積極性。目前綜合性實(shí)驗(yàn)已達(dá)到總實(shí)驗(yàn)量的56%,比10年前大大增加(表1)。對(duì)于一些驗(yàn)證性實(shí)驗(yàn),也盡力將其設(shè)計(jì)成具有_定探究性的設(shè)計(jì)性實(shí)驗(yàn),如"植物細(xì)胞的減數(shù)分裂"實(shí)驗(yàn)屬于帶有傳統(tǒng)意義的驗(yàn)證性實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)時(shí)由學(xué)生利用不同的材料進(jìn)行分組對(duì)比實(shí)驗(yàn),最終經(jīng)討論和比較分析得出正確的答案,這樣通過(guò)教學(xué)方法的改變使原來(lái)純梓驗(yàn)證性實(shí)驗(yàn)得到了_定的改變。又如"植物染色體核型分析"實(shí)驗(yàn)時(shí)約有1小時(shí)材料處理的等待時(shí)間,利用這_間隙插入"人類(lèi)Y染色體的進(jìn)化"等學(xué)生感興趣的實(shí)驗(yàn)小講座,其內(nèi)容綜合了近年來(lái)在Science、Nature等雜志上發(fā)表的有關(guān)Y染色體的研究進(jìn)展,講解Y染色體的過(guò)去、現(xiàn)在和將來(lái),引起了學(xué)生較大的興趣。在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,還可依托學(xué)科優(yōu)勢(shì),建立了科研與教學(xué)的共建平臺(tái),充分利用科研實(shí)驗(yàn)室的先進(jìn)儀器設(shè)備為《遺傳學(xué)》實(shí)驗(yàn)教學(xué)服務(wù),可使許多實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目的研究方法發(fā)生明顯的改變。如"西瓜染色體加倍〃綜合應(yīng)用性實(shí)驗(yàn),利用學(xué)院“211〃平臺(tái)的細(xì)胞流線儀,在西瓜三葉期就可鑒定加倍苗,提高了實(shí)驗(yàn)的效率;"油菜籽品質(zhì)遺傳率測(cè)定",利用科研平臺(tái)的近紅外品質(zhì)分析儀,方法簡(jiǎn)便快速、不破壞樣品,結(jié)果準(zhǔn)確。使學(xué)生在實(shí)驗(yàn)中能充分體驗(yàn)到高科技的魅力,達(dá)到科研反晡教學(xué)之目的。在實(shí)驗(yàn)教學(xué)的改革中,還要重視室外先進(jìn)實(shí)驗(yàn)基地建設(shè)以及實(shí)驗(yàn)室的開(kāi)放工作,鼓勵(lì)學(xué)生依據(jù)實(shí)驗(yàn)教學(xué)目的和自己的興趣愛(ài)好,自主設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)、自主完成實(shí)驗(yàn)、自主管理實(shí)驗(yàn),可以使學(xué)生的創(chuàng)新愿望得以實(shí)踐;同時(shí)積極鼓勵(lì)學(xué)生利用所學(xué)到的遺傳學(xué)知識(shí)參加教師的科研項(xiàng)目、爭(zhēng)取國(guó)家和省級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新項(xiàng)目、學(xué)校SRTP項(xiàng)目,引導(dǎo)和培養(yǎng)學(xué)生熟悉、參與、跟蹤世界生命科學(xué)前沿領(lǐng)域的能力,進(jìn)一步完善"開(kāi)放性、研究型"的教學(xué)模式,最大程度地培養(yǎng)學(xué)生的創(chuàng)新意識(shí)和創(chuàng)新能力。
1.4教學(xué)團(tuán)隊(duì)的建設(shè)
師資隊(duì)伍的建設(shè)有助于《遺傳學(xué)》課程持續(xù)發(fā)展。教師作為課程教學(xué)中的主導(dǎo),肩負(fù)著傳授知識(shí)的重任,教師隊(duì)伍的知識(shí)水平和操作技能直接影響著課程教學(xué)的效果。在長(zhǎng)期的教學(xué)過(guò)程中,本課程堅(jiān)持實(shí)行請(qǐng)好老師、用好教材、講好課程,打造精品課程的教學(xué)思路。教學(xué)隊(duì)伍中有教學(xué)名師或優(yōu)秀
教師,采用團(tuán)隊(duì)主編的國(guó)家"十一五"規(guī)劃教材和面向21世紀(jì)課程教材[21,22]以及獲獎(jiǎng)的教學(xué)課件,確保了《遺傳學(xué)》國(guó)家精品課程的教學(xué)質(zhì)量。在"學(xué)院主管、負(fù)責(zé)人總抓、團(tuán)隊(duì)骨干負(fù)責(zé)"的三級(jí)教學(xué)管理體制下,教學(xué)團(tuán)隊(duì)制定了具體建設(shè)規(guī)劃,形成了分工明確、協(xié)調(diào)統(tǒng)一的建設(shè)模式。在具體實(shí)施過(guò)程中,以學(xué)術(shù)帶頭人為中心、骨干教師為主力軍,青年教師為后備軍,造就了學(xué)歷、年齡、學(xué)緣、職稱(chēng)等結(jié)構(gòu)合理、學(xué)術(shù)水平好的高質(zhì)量教師隊(duì)伍。多年來(lái)堅(jiān)持首席主講教師負(fù)責(zé)制、合作備課、教學(xué)會(huì)議研討、學(xué)要求等方法取得了更好的教學(xué)效果。在實(shí)驗(yàn)教學(xué)中,多年來(lái)_直由具有博士學(xué)位的教師擔(dān)任主講,確保了《遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)》改革向縱深發(fā)展。同時(shí),利用學(xué)校學(xué)科門(mén)類(lèi)多、課程設(shè)置齊全的特點(diǎn),積極鼓勵(lì)教師參與綜合性實(shí)驗(yàn)的創(chuàng)建,選修具有最新遺傳學(xué)知識(shí)和技能的研究生課程,到外校進(jìn)修相關(guān)課程和切磋實(shí)驗(yàn)技能,掌握遺傳學(xué)最新的實(shí)驗(yàn)技術(shù),提高了任課教師的知識(shí)和教學(xué)水平,并減少了《遺傳學(xué)》與其它相關(guān)課程在內(nèi)容上的重復(fù)。教師間的觀摩教學(xué)和傳、幫、帶,也促進(jìn)了教師隊(duì)伍的整體提高。
1.5考試內(nèi)容和方法的改進(jìn)
《遺傳學(xué)》課程的考試內(nèi)容和方法既要考核學(xué)生對(duì)遺傳學(xué)基本規(guī)律、理論、概念和方法等知識(shí)的掌握程度,又要注重了解學(xué)生綜合運(yùn)用所學(xué)遺傳學(xué)知識(shí)分析、解決問(wèn)題的能力以及創(chuàng)新能力的水平。因此,考核命題要靈活多變,少出"死記硬背"題、多用"分析"和"理解"題,特別注重理論與實(shí)踐的結(jié)合以及學(xué)生獨(dú)立思考、分析遺傳學(xué)問(wèn)題和解決實(shí)際問(wèn)題能力等方面的測(cè)試;考核方式也要多樣化,如筆試、面試、課程論文結(jié)合,單項(xiàng)試題與綜合分析試題相結(jié)合等。評(píng)價(jià)時(shí)不僅要注重答題結(jié)果,更應(yīng)注重考核學(xué)生解答問(wèn)題時(shí)的思維方式和能力,對(duì)創(chuàng)新方面成績(jī)突出的學(xué)生予以表彰和加分。如2000年開(kāi)始采用的"理論綜合試題",其內(nèi)容能夠綜合全書(shū)的主要內(nèi)容,在開(kāi)課時(shí)提前將題目告訴學(xué)生,允許學(xué)生經(jīng)過(guò)_學(xué)期的學(xué)習(xí)和思考后再行完成,有利于學(xué)生對(duì)遺傳學(xué)知識(shí)的全面理解和綜合應(yīng)用能力的提高,且可給學(xué)生留有創(chuàng)新發(fā)揮的余地?!哆z傳學(xué)實(shí)驗(yàn)》考試則結(jié)合《實(shí)驗(yàn)情況記錄表》,把實(shí)驗(yàn)預(yù)習(xí)、操作、報(bào)告、紀(jì)律等納入考核范圍;實(shí)驗(yàn)全部結(jié)束后還要單獨(dú)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)原理和方法筆試,教師根據(jù)學(xué)生平時(shí)成績(jī)和考試成績(jī)給出最終成績(jī)。
1.6精品教材的編寫(xiě)
教材建設(shè)是《遺傳學(xué)》課程建設(shè)的重要方面,教材的選用與學(xué)生遺傳學(xué)整體知識(shí)的構(gòu)成有著密切關(guān)系[23]。我們根據(jù)教學(xué)課件內(nèi)容創(chuàng)編了具有明顯新意的"十一五"國(guó)家多媒體規(guī)劃教材《遺傳學(xué)》,具有傳統(tǒng)印刷教材所沒(méi)有的特點(diǎn)[21],已被省內(nèi)外多所院校在教學(xué)中采用。該教材編排獨(dú)特、文字精煉、圖文并茂,能夠適應(yīng)現(xiàn)代教育技術(shù)的教學(xué)新方法,特別是可以明顯減少學(xué)生上課做筆記的時(shí)間,集中精力聽(tīng)老師講解內(nèi)容;并有利于學(xué)生根據(jù)課件內(nèi)容學(xué)習(xí)和復(fù)習(xí)有關(guān)內(nèi)容,現(xiàn)已被推薦申報(bào)"十二五"國(guó)家規(guī)劃教材。在教學(xué)中還為學(xué)生提供30多本中英文參考資料,同時(shí)提供與遺傳學(xué)有關(guān)的_些相關(guān)雜志,這些學(xué)習(xí)資料在學(xué)校圖書(shū)館可以借閱,幫助學(xué)生學(xué)習(xí)和理解遺傳學(xué)基本知識(shí)。
1.7教學(xué)網(wǎng)站和教學(xué)共享平臺(tái)的建設(shè)
根據(jù)國(guó)家精品課程的建設(shè)要求,我們?cè)趯W(xué)校的支持下加大力度進(jìn)行《遺傳學(xué)》網(wǎng)站等共享平臺(tái)的建設(shè),使之具有鮮明特色、內(nèi)容豐富、共享性強(qiáng)等特點(diǎn)。教學(xué)大綱、教學(xué)進(jìn)度(曰歷)、教材、教學(xué)參考書(shū)和教學(xué)輔助資料(如教案、習(xí)題和參考答案、實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)、網(wǎng)絡(luò)版和課堂教學(xué)版多媒體課件及其他教學(xué)資料)已全部上網(wǎng),教師與學(xué)生對(duì)話式窗口,方便師生交流,形成了講授、答疑、討論、信息網(wǎng)絡(luò)化的教學(xué)平臺(tái),具有"高開(kāi)放"的特點(diǎn)。教學(xué)平臺(tái)的建設(shè)現(xiàn)已實(shí)現(xiàn)了《遺傳學(xué)》課程的校內(nèi)外無(wú)障礙共享,學(xué)生隨時(shí)可以點(diǎn)擊"jpkc.zju.edu.en/k/531/"網(wǎng)<jpkc.zju.edu.en/k/531/%22%e7%bd%91>址進(jìn)入網(wǎng)站學(xué)習(xí),與教師在線交流,并可上網(wǎng)利用模擬試題自主測(cè)驗(yàn)學(xué)習(xí)效果。教學(xué)網(wǎng)站的建設(shè)方便了學(xué)生和教師的使用,為學(xué)生提供了一個(gè)跨越時(shí)間和空間的學(xué)習(xí)環(huán)境。同時(shí)為了方便學(xué)生學(xué)習(xí),教學(xué)網(wǎng)站中收集和編輯了與《遺傳學(xué)》課程有關(guān)的多種學(xué)習(xí)資源,包括參考文獻(xiàn)、中外網(wǎng)絡(luò)資源、中外遺傳學(xué)重要期刊、遺傳學(xué)名詞英漢對(duì)照、名詞解釋、遺傳學(xué)研究領(lǐng)域諾貝爾獲獎(jiǎng)?wù)叩?。《遺傳學(xué)》課程已按教育部的要求完成課堂教學(xué)全程錄制和上網(wǎng)。
2優(yōu)質(zhì)教學(xué)體系的應(yīng)用效果
2.1提高了《遺傳學(xué)》課程的教學(xué)水平和教學(xué)質(zhì)量
優(yōu)質(zhì)教學(xué)體系的構(gòu)建促進(jìn)了《遺傳學(xué)》教學(xué)質(zhì)量的提高?!哆z傳學(xué)》現(xiàn)已成為國(guó)家精品課程,《遺傳學(xué)》教材為"國(guó)家十一五規(guī)劃教材”實(shí)驗(yàn)教
材為"面向21世紀(jì)課程教材”,自創(chuàng)的教學(xué)課件也獲得了全國(guó)"第六屆高等農(nóng)業(yè)院校多媒體課件評(píng)比_等獎(jiǎng)",教學(xué)團(tuán)隊(duì)師資質(zhì)量好,課程教學(xué)從內(nèi)容、方法和手段以及考核評(píng)價(jià)上形成一個(gè)科學(xué)優(yōu)質(zhì)教學(xué)體系,能夠保證課程教學(xué)質(zhì)量和水平。在整體上較好地解決了《遺傳學(xué)》教學(xué)內(nèi)容豐富、而教學(xué)時(shí)數(shù)有限的矛盾,也解決了多媒體課件好看、但筆記難記等問(wèn)題,符合學(xué)生的學(xué)習(xí)和認(rèn)知心理,在現(xiàn)代教育技術(shù)應(yīng)用與教學(xué)改革中發(fā)揮了顯著作用。教學(xué)效果的提高,促進(jìn)學(xué)生更加扎實(shí)地掌握遺傳學(xué)基本知識(shí)和基本技能,提高了分析問(wèn)題和解決問(wèn)題的能力,在參加教師科研項(xiàng)目的研究、爭(zhēng)取國(guó)家和省級(jí)創(chuàng)新項(xiàng)目及學(xué)校SRTP項(xiàng)目中發(fā)揮了作用。
2.2教改成果和教學(xué)資源共享應(yīng)用廣泛,輻射作用明顯。
《遺傳學(xué)》課程教學(xué)體系優(yōu)化中所做的_些教改工作以及《遺傳學(xué)》網(wǎng)站和教學(xué)平臺(tái)的創(chuàng)建,不但提高了課程的教學(xué)效果,也與其他一些高等院校《遺傳學(xué)》等課程的教學(xué)實(shí)現(xiàn)了資源共享,在全國(guó)發(fā)揮了良好的輻射作用。全國(guó)已有40多所高等院校的教師引入我們創(chuàng)建的《遺傳學(xué)》多媒體課件、教材和教學(xué)網(wǎng)站應(yīng)用于教學(xué)中。一些學(xué)校的教師也經(jīng)常來(lái)校觀摩和旁聽(tīng)我們的《遺傳學(xué)》課堂和實(shí)驗(yàn)教學(xué),交流《遺傳學(xué)》的教學(xué)經(jīng)驗(yàn)。目前我們創(chuàng)建的《遺傳學(xué)》網(wǎng)站點(diǎn)擊數(shù)已經(jīng)超過(guò)190000人次。精品課負(fù)責(zé)人在2010年全國(guó)遺傳學(xué)教學(xué)會(huì)議上對(duì)《遺傳學(xué)》多媒體教學(xué)課件創(chuàng)建、精品教材編寫(xiě)以及教學(xué)網(wǎng)站建設(shè)等支撐體系做了詳細(xì)介紹,得到了與會(huì)人員的充分肯定。2011年我們舉辦了全國(guó)《遺傳學(xué)》骨干教師高級(jí)研修班、全國(guó)大學(xué)生農(nóng)學(xué)創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)暑期培訓(xùn)班和浙江省首屆植物染色體制片技能大賽,擴(kuò)大了課程在全國(guó)的影響力。
3優(yōu)質(zhì)教學(xué)體系構(gòu)建的進(jìn)_步設(shè)想
第_,《遺傳學(xué)》課程的教學(xué)內(nèi)容豐富、信息量大,需進(jìn)_步整合和優(yōu)化《遺傳學(xué)》課程的教學(xué)內(nèi)容,積極探索適應(yīng)現(xiàn)代教育技術(shù)的教學(xué)新方法,力求在原有內(nèi)容的基礎(chǔ)上能夠更好地反映出遺傳學(xué)學(xué)科的最新進(jìn)展,以適應(yīng)不斷發(fā)展的新形勢(shì)教學(xué)要求。
第二,繼續(xù)改進(jìn)教學(xué)手段和方法,進(jìn)_步完善探討式、討論式授課方式,在課堂上盡量多留出一點(diǎn)時(shí)間與學(xué)生進(jìn)行交流和互動(dòng);同時(shí)鼓勵(lì)學(xué)生多利用功能強(qiáng)大的《遺傳學(xué)》網(wǎng)站學(xué)習(xí),提高教學(xué)效果。同時(shí)積極與省內(nèi)外有關(guān)院校交流《遺傳學(xué)》教學(xué)課件,實(shí)現(xiàn)校內(nèi)外教學(xué)資源的無(wú)障礙共享,提高《遺傳學(xué)》課程在全國(guó)的知名度。
第三,通過(guò)教學(xué)體系的建設(shè),進(jìn)一步完善《遺傳學(xué)》教學(xué)師資隊(duì)伍,在引進(jìn)高水平教師的同時(shí)著重培養(yǎng)和提高現(xiàn)有青年教師的教學(xué)水平,不斷提高教師的創(chuàng)新素質(zhì),以適應(yīng)遺傳學(xué)學(xué)科飛速發(fā)展的現(xiàn)狀。
第四,推進(jìn)探究性和開(kāi)放性教學(xué),創(chuàng)造條件開(kāi)設(shè)學(xué)生自主實(shí)驗(yàn),進(jìn)一步培養(yǎng)和提高學(xué)生的創(chuàng)新意識(shí)和創(chuàng)新能力。同時(shí)要充分發(fā)揮綜合性大學(xué)一流學(xué)科的強(qiáng)大支撐作用,做好教學(xué)與科研的結(jié)合工作,把科研中的新成果、新發(fā)現(xiàn)應(yīng)用到綜合性實(shí)驗(yàn)和設(shè)計(jì)性實(shí)驗(yàn)中去,不斷更新教學(xué)內(nèi)容,激發(fā)學(xué)生勇于發(fā)現(xiàn)和探索的潛能。
關(guān)鍵詞:統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué);在線開(kāi)放課程;創(chuàng)新人才
隨著科技競(jìng)爭(zhēng)的日趨激烈和人才國(guó)際化程度的不斷加快,我國(guó)拔尖人才日益緊缺。當(dāng)前高等教育工作的根本問(wèn)題是人才培養(yǎng)質(zhì)量問(wèn)題,其核心是學(xué)生創(chuàng)新精神和創(chuàng)新能力的培養(yǎng)。建立拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)的有效機(jī)制,促進(jìn)創(chuàng)新人才脫穎而出,促進(jìn)高校探索創(chuàng)新型人才培養(yǎng)的新模式,促進(jìn)高校探索并建立以問(wèn)題和課題為核心的教學(xué)模式,倡導(dǎo)以學(xué)生為主體的本科人才培養(yǎng)和研究型教學(xué)人才改革,調(diào)動(dòng)學(xué)生的學(xué)習(xí)積極性、主動(dòng)性和創(chuàng)造性,激發(fā)學(xué)生的創(chuàng)新思維和創(chuàng)新意識(shí),是建設(shè)創(chuàng)新型國(guó)家,實(shí)現(xiàn)中華民族偉大復(fù)興的歷史要求,也是當(dāng)前對(duì)教育改革的迫切要求。
高等醫(yī)學(xué)院校主要是以專(zhuān)業(yè)為依托,全面提高學(xué)生綜合素質(zhì)。但是在限定學(xué)時(shí)的情況下,按部就班的講解已不能滿(mǎn)足學(xué)生對(duì)知識(shí)的需求,不能滿(mǎn)足創(chuàng)新人才培養(yǎng)的需要。由于統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)教學(xué)學(xué)時(shí)相對(duì)較少,教師要完成教學(xué)計(jì)劃,所以學(xué)生創(chuàng)新能力的培養(yǎng)只依靠課堂理論教學(xué)不會(huì)有顯著效果。學(xué)生可以利用課余時(shí)間在網(wǎng)絡(luò)上繼續(xù)拓展學(xué)習(xí)、深入學(xué)習(xí)、實(shí)踐學(xué)習(xí)。但是學(xué)生如何獲得優(yōu)質(zhì)的學(xué)習(xí)資源,如何對(duì)學(xué)生創(chuàng)新能力的培養(yǎng)起到促進(jìn)作用?這就需要一個(gè)學(xué)習(xí)、交流和實(shí)踐的平臺(tái),統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程平臺(tái)建設(shè)就顯得尤為重要。
一、統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程建設(shè)的必要性和重要性
在線開(kāi)放課程模式與傳統(tǒng)課堂教學(xué)模式相比,具有顯著的優(yōu)勢(shì),學(xué)習(xí)不受時(shí)間段的限制。學(xué)習(xí)者可以合理安排進(jìn)行個(gè)性化的學(xué)習(xí),反復(fù)觀看教學(xué)視頻,可以分析具體的問(wèn)題,直到理解掌握為止。統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程建設(shè)將以服務(wù)平臺(tái)建設(shè)的形式,使學(xué)習(xí)者可以充分利用平臺(tái)資源,高效參與完整的教學(xué)過(guò)程。因此,統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程教學(xué)模式更方便學(xué)習(xí)者對(duì)知識(shí)點(diǎn)的學(xué)習(xí),彌補(bǔ)課堂教學(xué)的不足。在線開(kāi)放課程教學(xué)模式增強(qiáng)了教學(xué)吸引力,激發(fā)了學(xué)習(xí)者的學(xué)習(xí)積極性和自主性,擴(kuò)大了優(yōu)質(zhì)教育資源受益面,拓展了教學(xué)時(shí)空,有著傳統(tǒng)課堂教學(xué)模式無(wú)法比擬的優(yōu)勢(shì),給高等醫(yī)學(xué)院校教學(xué)改革帶來(lái)了新的機(jī)遇和挑戰(zhàn)。
統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)是利用統(tǒng)計(jì)學(xué)的方法,借助計(jì)算機(jī)的實(shí)現(xiàn)手段,研究生命體基因組遺傳和變異的一門(mén)應(yīng)用型課程。它是我校生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)重要的專(zhuān)業(yè)課,教學(xué)效果的好壞,直接影響到學(xué)生后續(xù)畢業(yè)設(shè)計(jì)的完成效果。其目標(biāo)是通過(guò)課程學(xué)習(xí),培養(yǎng)學(xué)生利用統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)方法解決生物信息學(xué)相關(guān)問(wèn)題,而這恰恰是一個(gè)從理論到實(shí)踐的過(guò)程。如果統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程得到建設(shè)并實(shí)踐應(yīng)用,它的相關(guān)理論和方法可以幫助遺傳學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)和預(yù)防醫(yī)學(xué)等專(zhuān)業(yè)解決實(shí)際問(wèn)題,醫(yī)學(xué)院校其他專(zhuān)業(yè)的學(xué)生也可以利用網(wǎng)絡(luò)資源學(xué)習(xí)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)知識(shí),并成為其他專(zhuān)業(yè)學(xué)生了解生物信息的一個(gè)前導(dǎo)課程,提高統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)的應(yīng)用價(jià)值。因此,在線開(kāi)放課程是培養(yǎng)學(xué)生生物信息學(xué)創(chuàng)新思維能力的重要途徑和手段,是高等醫(yī)學(xué)院校人才培養(yǎng)的需要和交流溝通的平臺(tái)。
二、統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程建設(shè)的主要平臺(tái)
結(jié)合高等醫(yī)學(xué)院校的特色,滿(mǎn)足高等醫(yī)學(xué)院校的統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)教學(xué)和學(xué)習(xí)者利用閑暇時(shí)間學(xué)習(xí)的需要,并以使統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程在實(shí)踐中得到應(yīng)用為目標(biāo),以學(xué)生自主創(chuàng)新實(shí)踐為中心,建立與學(xué)生創(chuàng)新思維能力相適應(yīng)的統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)開(kāi)放課程體系。擬解決理論與實(shí)踐相脫離、學(xué)生合作意識(shí)差、缺少學(xué)生自主構(gòu)建知識(shí)與能力的實(shí)踐活動(dòng)、缺少科學(xué)探究氛圍和缺乏對(duì)學(xué)生綜合能力的評(píng)價(jià)等問(wèn)題。達(dá)到高等醫(yī)學(xué)院校對(duì)創(chuàng)新人才培養(yǎng)的目的。
(一)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程的資源庫(kù)平臺(tái)建設(shè)
統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程的課程資源庫(kù)包括基礎(chǔ)教學(xué)資源和學(xué)術(shù)拓展資源。基礎(chǔ)教學(xué)資源包括統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)的重要理論知識(shí)講解視頻、統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)常用軟件講解及介紹、統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)相關(guān)內(nèi)容(連鎖分析、關(guān)聯(lián)分析、群體遺傳學(xué)等)的分析實(shí)例及數(shù)據(jù)等資源,給學(xué)生提供統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)基礎(chǔ)理論的學(xué)習(xí)平臺(tái),數(shù)據(jù)集庫(kù)是常用的分析數(shù)據(jù)集及數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接,供學(xué)生練習(xí)和測(cè)試用。理論和實(shí)例相結(jié)合,提高學(xué)生分析問(wèn)題和解決問(wèn)題的能力;學(xué)術(shù)拓展資源包括統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)的應(yīng)用領(lǐng)域、用統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)可以解決的科學(xué)問(wèn)題、統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)研究進(jìn)展及近期前沿?zé)狳c(diǎn)問(wèn)題等資源,開(kāi)拓學(xué)生視野。
(二)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程的學(xué)生測(cè)試平臺(tái)建設(shè)
建設(shè)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程的學(xué)生測(cè)試平臺(tái),調(diào)用數(shù)據(jù)集庫(kù)中的數(shù)據(jù),應(yīng)用學(xué)到的統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)知識(shí)解決實(shí)際問(wèn)題,通過(guò)理論和實(shí)驗(yàn)的方式進(jìn)行測(cè)試,考核學(xué)生對(duì)基本理論知識(shí)的掌握程度,及時(shí)發(fā)現(xiàn)問(wèn)題,彌補(bǔ)知識(shí)欠缺。使統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程在教學(xué)中得到很好的實(shí)踐應(yīng)用。
(三)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程的實(shí)踐與創(chuàng)新平臺(tái)建設(shè)
建設(shè)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程的實(shí)踐與創(chuàng)新平臺(tái),定期留一些具體分析實(shí)例的題目,讓學(xué)生自由分組,開(kāi)展自主探究活動(dòng),各組自行設(shè)計(jì)方案,最后對(duì)應(yīng)的各個(gè)題目進(jìn)行分組匯報(bào),激發(fā)學(xué)生的主動(dòng)探究精神,培養(yǎng)團(tuán)隊(duì)精神,提高學(xué)生的創(chuàng)新和實(shí)踐能力。
三、統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程建設(shè)具體思路及實(shí)施方案
(一)組建團(tuán)隊(duì)建設(shè)統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程資源庫(kù)
統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)教學(xué)團(tuán)隊(duì)由教學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富的5名教師組成,統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程建設(shè)資源庫(kù)的建設(shè)包括基礎(chǔ)教學(xué)資源和學(xué)術(shù)拓展資源,由基礎(chǔ)到實(shí)踐再到學(xué)術(shù)前沿應(yīng)用。基礎(chǔ)教學(xué)資源包括教學(xué)章節(jié)理論內(nèi)容視頻、實(shí)驗(yàn)課常用軟件講解和常用分析的實(shí)例演示。按照教學(xué)大綱要求的重點(diǎn)和難點(diǎn),團(tuán)隊(duì)中的教師根據(jù)各自擅長(zhǎng)的章節(jié)內(nèi)容的知識(shí)點(diǎn)進(jìn)行視頻錄制,教學(xué)視頻要根據(jù)知識(shí)點(diǎn)難易程度去設(shè)計(jì),每一個(gè)知識(shí)點(diǎn)錄制成一段微視頻,一個(gè)教學(xué)視頻一般不超過(guò)20分鐘;挑選典型性?xún)?nèi)容做實(shí)例分析演示進(jìn)行視頻的錄制等。學(xué)術(shù)拓展資源是統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的研究成果,教師每周都查找國(guó)內(nèi)外文獻(xiàn),搜集最新的科研成果放在統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程的學(xué)術(shù)拓展資源中,讓學(xué)生了解統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在生命科學(xué)中的應(yīng)用,激發(fā)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣,體現(xiàn)該課程的重要性。
(二)組建統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程技術(shù)團(tuán)隊(duì)
為了取得更好的統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程設(shè)計(jì)效果,聘請(qǐng)專(zhuān)業(yè)人員給課題組人員進(jìn)行視頻錄制、頁(yè)面設(shè)計(jì)等方面的技術(shù)培訓(xùn)。讓統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程平臺(tái)更具特色、更吸引人眼球。同時(shí)對(duì)課程內(nèi)容及環(huán)節(jié)進(jìn)行整體設(shè)計(jì),使其內(nèi)容豐富、精彩、精練,知識(shí)體系銜接緊密、結(jié)構(gòu)合理,提高課程吸引力和授課效果,給人一種耳目一新的感覺(jué),激發(fā)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣。
(三)建立統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)在線開(kāi)放課程的實(shí)踐與創(chuàng)新平臺(tái)
關(guān)鍵詞: 生物信息學(xué) 農(nóng)業(yè)研究領(lǐng)域 應(yīng)用
“生物信息學(xué)”是英文單詞“Bioinformatics”的中文譯名,其概念是1956年在美國(guó)田納西州Gatlinburg召開(kāi)的“生物學(xué)中的信息理論”討論會(huì)上首次被提出的[1],由美國(guó)學(xué)者Lim在1991年發(fā)表的文章中首次使用。生物信息學(xué)自產(chǎn)生以來(lái),大致經(jīng)歷了前基因組時(shí)代、基因組時(shí)代和后基因組時(shí)代三個(gè)發(fā)展階段[2]。2003年4月14日,美國(guó)人類(lèi)基因組研究項(xiàng)目首席科學(xué)家Collins F博士在華盛頓隆重宣布人類(lèi)基因組計(jì)劃(Human Genome Project,HGP)的所有目標(biāo)全部實(shí)現(xiàn)[3]。這標(biāo)志著后基因組時(shí)代(Post Genome Era,PGE)的來(lái)臨,是生命科學(xué)史中又一個(gè)里程碑。生物信息學(xué)作為21世紀(jì)生物技術(shù)的核心,已經(jīng)成為現(xiàn)代生命科學(xué)研究中重要的組成部分。研究基因、蛋白質(zhì)和生命,其研究成果必將深刻地影響農(nóng)業(yè)。本文重點(diǎn)闡述生物信息學(xué)在農(nóng)業(yè)模式植物、種質(zhì)資源優(yōu)化、農(nóng)藥的設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)、作物遺傳育種、生態(tài)環(huán)境改善等方面的最新研究進(jìn)展。
1.生物信息學(xué)在農(nóng)業(yè)模式植物研究領(lǐng)域中的應(yīng)用
1997年5月美國(guó)啟動(dòng)國(guó)家植物基因組計(jì)劃(NPGI),旨在繪出包括玉米、大豆、小麥、大麥、高粱、水稻、棉花、西紅柿和松樹(shù)等十多種具有經(jīng)濟(jì)價(jià)值的關(guān)鍵植物的基因圖譜。國(guó)家植物基因組計(jì)劃是與人類(lèi)基因組工程(HGP)并行的龐大工程[4]。近年來(lái),通過(guò)各國(guó)科學(xué)家的通力合作,植物基因組研究取得了重大進(jìn)展,擬南芥、水稻等模式植物已完成了全基因組測(cè)序。人們可以使用生物信息學(xué)的方法系統(tǒng)地研究這些重要農(nóng)作物的基因表達(dá)、蛋白質(zhì)互作、蛋白質(zhì)和核酸的定位、代謝物及其調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)等,從而從分子水平上了解細(xì)胞的結(jié)構(gòu)和功能[5]。目前已經(jīng)建立的農(nóng)作物生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)研究平臺(tái)有植物轉(zhuǎn)錄本(TA)集合數(shù)據(jù)庫(kù)TIGR、植物核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)PlantGDB、研究玉米遺傳學(xué)和基因組學(xué)的MazeGDB數(shù)據(jù)庫(kù)、研究草類(lèi)和水稻的Gramene數(shù)據(jù)庫(kù)、研究馬鈴薯的PoMaMo數(shù)據(jù)庫(kù),等等。
2.生物信息學(xué)在種質(zhì)資源保存研究領(lǐng)域中的應(yīng)用
種質(zhì)資源是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的重要資源,它包括許多農(nóng)藝性狀(如抗病、產(chǎn)量、品質(zhì)、環(huán)境適應(yīng)性基因等)的等位基因。植物種質(zhì)資源庫(kù)是指以植物種質(zhì)資源為保護(hù)對(duì)象的保存設(shè)施。至1996年,全世界已建成了1300余座植物種質(zhì)資源庫(kù),在我國(guó)也已建成30多座作物種質(zhì)資源庫(kù)。種質(zhì)入庫(kù)保存類(lèi)型也從單一的種子形式,發(fā)展到營(yíng)養(yǎng)器官、細(xì)胞和組織,甚至DN段等多種形式。保護(hù)的物種也從有性繁殖植物擴(kuò)展到無(wú)性繁殖植物及頑拗型種子植物等[6]。近年來(lái),人們?cè)絹?lái)越多地應(yīng)用各種分子標(biāo)記來(lái)鑒定種質(zhì)資源。例如微衛(wèi)星、AFLP、SSAP、RBIP和SNP等。由于對(duì)種質(zhì)資源進(jìn)行分子標(biāo)記產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù),因此需要建立生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和采用分析工具來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)這些數(shù)據(jù)的查詢(xún)、統(tǒng)計(jì)和計(jì)算機(jī)分析等[7]。
3.生物信息學(xué)在農(nóng)藥設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)研究領(lǐng)域中的應(yīng)用
傳統(tǒng)的藥物研制主要是從大量的天然產(chǎn)物、合成化合物,以及礦物中進(jìn)行篩選,得到一個(gè)可供臨床使用的藥物要耗費(fèi)大量的時(shí)間與金錢(qián)。生物信息學(xué)在藥物研發(fā)中的意義在于找到病理過(guò)程中關(guān)鍵性的分子靶標(biāo)、闡明其結(jié)構(gòu)和功能關(guān)系,從而指導(dǎo)設(shè)計(jì)能激活或阻斷生物大分子發(fā)揮其生物功能的治療性藥物,使藥物研發(fā)之路從過(guò)去的偶然和盲目中找到正確的研發(fā)方向。生物信息學(xué)為藥物研發(fā)提供了新的手段[8,9],導(dǎo)致了藥物研發(fā)模式的改變[10]。目前,生物信息學(xué)促進(jìn)農(nóng)藥研制已有許多成功的例子。Itzstein等設(shè)計(jì)出兩種具有與唾液酸酶結(jié)合化合物:4-氨基-Neu5Ac2en和4-胍基-Neu5Ac2en。其中,后者是前者與唾液酸酶的結(jié)合活性的250倍[11]。目前,這兩種新藥已經(jīng)進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段。TANG SY等學(xué)者研制出新一代抗AIDS藥物saquinavir[12]。Pungpo等已經(jīng)設(shè)計(jì)出幾種新型高效的抗HIV-1型藥物[13]。楊華錚等人設(shè)計(jì)合成了十多類(lèi)數(shù)百個(gè)除草化合物,經(jīng)生物活性測(cè)定,部分化合物的活性已超過(guò)商品化光合作用抑制劑的水平[14]。
現(xiàn)代農(nóng)藥的研發(fā)已離不開(kāi)生物信息技術(shù)的參與,隨著生物信息學(xué)技術(shù)的進(jìn)一步完善和發(fā)展,將會(huì)大大降低藥物研發(fā)的成本,提高研發(fā)的質(zhì)量和效率。
4.生物學(xué)信息學(xué)在作物遺傳育種研究領(lǐng)域中的應(yīng)用
隨著主要農(nóng)作物遺傳圖譜精確度的提高,以及特定性狀相關(guān)分子基礎(chǔ)的進(jìn)一步闡明,人們可以利用生物信息學(xué)的方法,先從模式生物中尋找可能的相關(guān)基因,然后在作物中找到相應(yīng)的基因及其位點(diǎn)。農(nóng)作物的遺傳學(xué)和分子生物學(xué)的研究積累了大量的基因序列、分子標(biāo)記、圖譜和功能方面的數(shù)據(jù),可通過(guò)建立生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)整合這些數(shù)據(jù),從而比較和分析來(lái)自不同基因組的基因序列、功能和遺傳圖譜位置[15]。在此基礎(chǔ)上,育種學(xué)家就可以應(yīng)用計(jì)算機(jī)模型來(lái)提出預(yù)測(cè)假設(shè),從多種復(fù)雜的等位基因組合中建立自己所需要的表型,然后從大量遺傳標(biāo)記中篩選到理想的組合,從而培育出新的優(yōu)良農(nóng)作物品種。
5.生物信息學(xué)在生態(tài)環(huán)境平衡研究領(lǐng)域中的應(yīng)用
在生態(tài)系統(tǒng)中,基因流從根本上影響能量流和物質(zhì)流的循環(huán)和運(yùn)轉(zhuǎn),是生態(tài)平衡穩(wěn)定的根本因素。生物信息學(xué)在環(huán)境領(lǐng)域主要應(yīng)用在控制環(huán)境污染方面,主要通過(guò)數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)的運(yùn)用構(gòu)建遺傳工程特效菌株,以降解目標(biāo)基因及其目標(biāo)污染物為切入點(diǎn),通過(guò)降解污染物的分子遺傳物質(zhì)核酸 DNA,以及生物大分子蛋白質(zhì)酶,達(dá)到催化目標(biāo)污染物的降解,從而維護(hù)空氣[16]、水源、土地等生態(tài)環(huán)境的安全。
美國(guó)農(nóng)業(yè)研究中心(ARS) 的農(nóng)藥特性信息數(shù)據(jù)庫(kù)(PPD) 提供 334 種正在廣泛使用的殺蟲(chóng)劑信息,涉及它們?cè)诃h(huán)境中轉(zhuǎn)運(yùn)和降解途徑的16種最重要的物化特性。日本豐橋技術(shù)大學(xué)(Toyohashi University of Technology) 多環(huán)芳烴危險(xiǎn)性有機(jī)污染物的物化特性、色譜、紫外光譜的譜線圖。美國(guó)環(huán)保局綜合風(fēng)險(xiǎn)信息系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫(kù)(IRIS) 涉及 600種化學(xué)污染物,列出了污染物的毒性與風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)參數(shù),以及分子遺傳毒性參數(shù)[17]。除此之外,生物信息學(xué)在生物防治[18]中也起到了重要的作用。網(wǎng)絡(luò)的普及,情報(bào)、信息等學(xué)科的資源共享,勢(shì)必會(huì)創(chuàng)造出一個(gè)環(huán)境微生物技術(shù)信息的高速發(fā)展趨勢(shì)。
6.生物信息學(xué)在食品安全研究領(lǐng)域中的應(yīng)用
食品在加工制作和存儲(chǔ)過(guò)程中各種細(xì)菌數(shù)量發(fā)生變化,傳統(tǒng)檢測(cè)方法是進(jìn)行生化鑒定,但所需時(shí)間較長(zhǎng),不能滿(mǎn)足檢驗(yàn)檢疫部門(mén)的要求,運(yùn)用生物信息學(xué)方法獲得各種致病菌的核酸序列,并對(duì)這些序列進(jìn)行比對(duì),篩選出用于檢測(cè)的引物和探針,進(jìn)而運(yùn)用PCR法[19]、RT-PCR法、熒光RT-PCR法、多重PCR[20]和多重?zé)晒舛縋CR等技術(shù),可快速準(zhǔn)確地檢測(cè)出細(xì)菌及病毒。此外,對(duì)電阻抗、放射測(cè)量、ELISA法、生物傳感器、基因芯片等[21-25]技術(shù)也是未來(lái)食品病毒檢測(cè)的發(fā)展方向。
轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)是通過(guò)設(shè)計(jì)特異性的引物對(duì)食品樣品的DNA提取物進(jìn)行擴(kuò)增,從而判斷樣品中是否含有外源性基因片段[26]。通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品數(shù)據(jù)庫(kù)信息的及時(shí)更新,可準(zhǔn)確了解各國(guó)新出現(xiàn)和新批準(zhǔn)的轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品,便于查找其插入的外源基因片段,以便及時(shí)對(duì)檢驗(yàn)方法進(jìn)行修改。目前由于某些通過(guò)食品傳播的病毒具有變異特性,以及檢測(cè)方法的不完善等因素影響,生物信息學(xué)在食品領(lǐng)域的應(yīng)用還比較有限,但隨著食品安全檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)的不斷完善,相信相關(guān)的生物信息學(xué)技術(shù)將在食品領(lǐng)域發(fā)揮越來(lái)越重要的作用。
生物信息學(xué)廣泛用于農(nóng)業(yè)科學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域,但是僅有信息資源是不夠的,選出符合自己需求的生物信息就需要情報(bào)部門(mén),以及信息中介服務(wù)機(jī)構(gòu)提供相關(guān)服務(wù),通過(guò)出版物、信息共享平臺(tái)、數(shù)字圖書(shū)館、電子論壇等信息媒介的幫助,科研工作者可快速有效地找到符合需要的信息。目前我國(guó)生物信息學(xué)發(fā)展還很不均衡,與國(guó)際前沿有一定差距,這需要從事信息和科研的工作者們不斷交流,使得生物信息學(xué)能夠更好地為我國(guó)農(nóng)業(yè)持續(xù)健康發(fā)展發(fā)揮作用。
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